嗜水气单胞菌诱导的池蝶蚌血细胞cDNA文库的构建和亲环蛋白基因序列的初步分析-长江水产研究所 长江水产研究所
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嗜水气单胞菌诱导的池蝶蚌血细胞cDNA文库的构建和亲环蛋白基因序列的初步分析

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    实验利用灭活的嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)诱导处于四龄池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)14h,将诱导后的池蝶蚌血细胞的总 RNA进行逆转录,用LD-PCR法合成双链 cDNA,从而首次成功构建池蝶蚌血细胞的全长cDNA 文库。原始文库的滴度为4×106cfu/cm3,重组率为 90%,扩增后文库的滴度为3.55×109pfu/mL。目前文库已随机测序672个样品,将所得双向序列进行拼接,去除载体,并多序列比对去除重复序列后,发现436 条为已知功能序列,其余为未知功能序列。序列中最小长度270 bp,最大长度为2153 bp,平均大小608.6 bp,表明插入片段大小理想。从文库中筛选获得免疫相关基因池蝶蚌亲环蛋白A(HsCyp A)全长基因并进行序列分析。结果显示,HsCyp A 全长1229 bp,序列包括52 bp 的5′非编码区、495bp的开放阅读框、682bp的3′非编码区和29bp的poly(A)尾,没有明显的加尾信号。对Cyp A 氨基酸序列二级结构进行了较详细的分析并进行了三维建模,同时构建了其系统进化树, 分析表明亲环蛋白家族是一个在进化上非常保守的蛋白家族。综合分析,Cyp A在水生动物中不仅仅只是一种组成型蛋白,而是可能在病原感染防御中发挥重要作用。[水生生物学报,2011,5(35):783-789]    作者:谢 凯,徐 灵,盛军庆等。(南昌大学生命科学与食品工程学院)
 
日期:2011-09-19 阅读:次
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