长江水产研究所渔业资源与环境保护研究室有专职研究人员15名，其中研究员3人，副研究员1人，助理研究员11人，其中博士6人，硕士7人。

　　该研究室主要从事长江流域生态系统与渔业资源变动机制、渔业资源量可捕捞量及可持续管理技术、退化渔场生态系统重建与环境修复技术、湿地生态系统保护技术、渔业资源增殖、渔业生物多样性保护与种质资源保存、退化水域生态系统重建与修复、渔业环境监测技术、水生态毒理学等领域的相关研究，以及过鱼设施设计、渔业水域生态环境监测和水生态环境质量综合评价、环境影响评价，渔业污染事故调查和鉴定等相关工作。

　　以研究室为主体，建立了农业部长江中上游渔业资源环境重点野外科学观测试验站(重庆)，农业部长江中上游渔业生态环境监测中心，长江中上游渔业资源监测站，中国水产科学研究院长江中上游渔业资源养护功能实验室、中国水产科学研究院水工程渔业生态效应评估功能实验室。

　　该研究室建立以来，承担了科技部、农业部、国家自然科学基金、环境保护部、三峡总公司、水利部等部门的科研、调查和监测项目，在保护长江中上游渔业资源和环境、维护生态平衡，维持流域渔业可持续利用等方面做出了积极的贡献。

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