近来，长江水产研究所鱼类病害研究室在鱼病现场诊断与门诊病例中，陆续从患病鲫鱼、白鲢、草鱼、鲟鱼等体内检测到孢子虫感染，表现出感染率高、死亡率高等特点，对水产养殖业造成重大危害。在治疗过程中，采用含阿维菌素类药物的市销杀灭孢子虫的制剂，参考其使用说明中标示的剂量，有较好的治疗效果。

    此外，如果采用1.8%浓度的伊维菌素溶液全池泼洒治疗孢子虫病，其剂量为0.08毫升/每立方米水体，充分稀释后再均匀泼洒。采用0.2%伊维菌素溶液全池泼洒治疗孢子虫病，剂量为0.08毫升/每立方米水体，充分稀释后再均匀泼洒；伊维菌素内服方法：0.3毫克/每公斤鱼体重，每日一次，连为三天。预防孢子虫病，须清除池塘过多淤泥，用生石灰彻底清塘；对池塘水体或循环水体进行消毒处理，并保持水质清洁。不要使用未经充分发酵的动物或畜禽粪便肥水。