栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒荧光定量PCR检测方法的建立和应用-长江水产研究所 长江水产研究所
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栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒荧光定量PCR检测方法的建立和应用

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    根据栉孔扇贝(Chlamys farreri)急性病毒性坏死病毒(Acute viral necrobiotic virus,AVNV)的基因序列,选择保守区段,应用Beacon Designer 7.0软件设计了一对能特异性扩增90bp片段的引物和TaqMan探针,建立并完善了AVNV荧光定量聚合酶链式反应(Fluorescent quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)诊断方法。该方法在108~102病毒拷贝范围内有较好的线性关系,AVNV拷贝数(X)和循环数(Ct)的相关关系为:lgX=-0.29Ct+13.28(相关系数R2=0.998)检测AVNV的灵敏度为102拷贝特异性实验表明只对AVNV基因组呈阳性反应。应用FQ-PCR对76份采自夏季发病期前后的栉孔扇贝样品进行检测,结果发现68份样品检测结果为阳性,阳性检出率为89.47%,高于普通PCR的阳性检出率(80.26%)。研究结果表明,该方法快速、灵敏,特异、重复性良好且能实现AVNV的定量检测,对AVNV的快速诊断和分子流行病学的调查以及AVNV疫情监测具有重要意义。[中国水产科学,2009,16(4):564-571]    作者:任伟成、王崇明、孙世春等人。(中国海洋大学  水产学院,中国水产科学研究院  黄海水产研究所)
日期:2009-09-13 阅读:次
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