溶藻弧菌诱导凡纳滨对虾消减文库的构建及其表达序列标签分析-长江水产研究所 长江水产研究所
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溶藻弧菌诱导凡纳滨对虾消减文库的构建及其表达序列标签分析

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    利用抑制消减杂交技术构建了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)诱导的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)血淋巴细胞cDNA 文库。用DNAMAN 5.2.2 软件对560 条高质量的ESTs 进行聚类, 共获得239 个Unigenes。与GenBank 进行BLASTx 和BLASTn 同源比较, 其中66.9%为已知功能基因, 33.1%为未知功能基因, GO 分类将其分为7 类, 包括能量和基础代谢类相关的基因为第一大类占36%, 免疫相关基因占15%, 其他基因占8%, 信号转导类占3%, 抗氧化酶和凋亡相关蛋白均为2%, 核蛋白类占1%。实验结果表明凡纳滨对虾在溶藻弧菌诱导下可产生一系列特异基因的表达, 通过对文库的分析显示, 基于PCR 方法建立的SSH 文库为取得大量免疫相关基因的ESTs 序列提供了可能。[水生生物学报,2010,34(1):157-163]    作者:蔡小辉,鲁义善,吴灶和,简纪常,王蓓,蔡双虎。(广东海洋大学水产学院)
日期:2010-03-03 阅读:次
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