鲢中华鳋线粒体基因组的基因组成及特征分析-长江水产研究所 长江水产研究所
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鲢中华鳋线粒体基因组的基因组成及特征分析

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    研究旨在测定隶属桡足亚纲(Copepoda)杯口水蚤目(Poicilostomatoida)的寄生甲壳动物鲢中华鳋(Sinergasilus polycolpus)线粒体DNA (mtDNA)序列, 分析其结构特征, 为节肢动物系统进化研究积累资料。利用简并引物扩增鲢中华鳋Cyt b CO I 基因片断, 据此设计特异性引物Long-PCR 扩增鲢中华鳋mtDNA序列, 拼接后得到12917 bp 的序列(GenBank 登录号为EU621723)。这段序列A、T、C、G 碱基含量分别为35.0%、35.8%、14.0%和15.2%, GC-Skew 和AT-Skew 值分别为0.041 和𕒴.011。通过序列同源性和结构分析, 鉴定了35 个基因, 包括13 个蛋白编码基因、21 个tRNA 基因和1 个12S rRNA 基因, 推测未能扩增到的片段包含16S rRNA、tRNAArg 和tRNAThr 基因以及控制区序列。tRNA 基因长度在54—63bp 之间, 均可折叠成典型的三叶草结构, 但TψC 臂长度变化较大, 其中有三个缺少TψC 臂。35 个基因中, 4 个蛋白质编码基因和7 个tRNA 基因位于N 链, 其余的位于J 链。基因间重叠有12 处, 重叠碱基量达159 bp。进一步研究桡足类及相关类群线粒体基因组的遗传特征将有助于揭示和阐明桡足类系统发育关系。[水生生物学报,2010,34(1):177-183]    作者:彭国祥,高谦,宋英,赵琴平,罗宇良,聂品。(华中农业大学水产学院,中国科学院水生生物研究所,武汉大学基础医学院)
日期:2010-03-04 阅读:次
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