中国明对虾肝胰腺细小病毒是一种单链、线性DNA病毒。本研究利用DNA末端加尾和嵌套PCR 首次完成了对虾肝胰腺细小病毒(hepatopancreatic parvovirus, HPV)中国分离株(HPV-Pc)全基因组序列的测定, 研究结果表明, HPV-Pc 株(GenBank 登录号GU371276)的全基因组由6 085 个核苷酸组成, 包含3 个开放阅读框(ORF) (分别代表ns1、ns2 和cp 基因)和2 个非编码区。ORF1、ORF2 和ORF3 分别编码由427、578 和821 个氨基酸组成的蛋白,分子量分别为50.4 kD、68.2 kD 和92 kD。分析HPV-Pc 基因组结构, 发现该基因组没有末端反向重复序列(ITR), cp基因编码的CP 区有HPV 特异的“GAA”正向重复序列, 及富含甘氨酸的上游和下游不同位置存在精氯酸残基, 可造成蛋白裂解。不同地区、不同对虾HPV 基因组有较大差异, HPV-Pc 株基因组与其他已知HPV 序列同源性在78%～91%之间, 差异遍布整个序列中。将HPV-Pc 各基因片段与已报道的其他地区HPV 相应序列进行比较, 结果表明, HPV-Pc 各基因片段与AY008257(韩国株)同源性最高。与已知HPV 代表株的NS2、NS1 和CP 蛋白氨基酸序列同源性比较也显示, HPV-Pc 株与韩国株同源性最高。这些特征表明HPV-Pc 属于细小病毒科的一个新分离株。[中国水产科学, 2011, 18(1)：59–65]    作者：张峥，黄倢，高强，成君军，王明森。（中国水产科学研究院黄海水产研究所，上海海洋大学，中国科学院海洋研究所）